Сравнение методов прямого нанесения биомассы и белковых экстрактов при идентификации микроорганизмов рода Listeria методом MALDI-TOF-типирования

Listeria monocytogenes является этиологическим агентом листериозной инфекции – широко распространенного опасного заболевания человека и животных. Заражение листериозом происходит при употреблении в пищу зараженных овощей и продуктов животного происхождения. Точное и быстрое определение возбудителя инфекции является ключом к назначению эффективного и адекватного лечения. Большой практический интерес представляет и видовая идентификация бактерий рода Listeria, так как у людей известны случаи заболеваний, вызванных Listeria ivanovii, следовательно, важно точно дифференцировать патогенные и непатогенные виды листерий. Одним из потенциально важных методов, способных решать эти задачи, является времяпролетная матрично-активированная лазерная десорбция/ионизация MALDI-TOF, которая является удобным инструментом для анализа микроорганизмов. Вместе с тем в литературных источниках встречаются упоминания о том, что не всегда видовая идентификация бактерии рода Listeria методом MALDI-TOF проходит корректно. Мы предположили, что это может быть следствием влияния различных факторов, таких как условия культивирования, состав питательных сред, а также уровень полиморфизма штаммов, взятых для исследований.
В настоящей работе на 35 штаммах L. monocytogenes, L. innocua, L. welshimeri, L. ivanovii, L. grayi и L. seeligeri, полученных из Государственной коллекции патогенных микроорганизмов «ГКПМ-Оболенск», проведен сравнительный анализ точности идентификации при использовании двух способов пробоподготовки – метода прямого нанесения и метода экстракции белков муравьиной кислотой и ацетонитрилом. Независимо от метода нанесения принадлежность к роду Listeria была корректно установлена во всех образцах. Однако видовая идентификация при прямом нанесении
была некорректна в девяти экспериментах, а при применении метода экстракции – в трех. Мы предполагаем, что это можно объяснить тем, что отобранные для проведения работ штаммы представляют разнородную группу клинических изолятов, выделенных на территории Российской Федерации.

Ключевые слова: листерия, масс-спектр, MALDI-TOF MS, идентификация, Microflex, MALDI-biotyper.

Для цитирования: Детушев К.В., Богун А.Г., Мухина Т.Н., Соломенцев В.И. Сравнение методов прямого нанесения биомассы и белковых экстрактов при идентификации микроорганизмов рода Listeria методом MALDI-TOF-типирования. Бактериология. 2018; 3(3): 28–33.
DOI: 10.20953/2500-1027-2018-3-28-33

Читать статью

Яндекс.Метрика