Использование гена, кодирующего белок GamR, в качестве видоспецифического хромосомного маркера для дифференциации B. anthracis от близкородственных видов

Автор / Мед учреждения

Тимофеев Виталий Сергеевич / ФБУН Государственный научный центр прикладной микробиологии и биотехнологии Роспотребнадзора, Оболенск, Российская Федерация

Каптелова Валерия Владимировна / ФБУН Государственный научный центр прикладной микробиологии и биотехнологии Роспотребнадзора, Оболенск, Российская Федерация

Бахтеева Ирина Викторовна / ФБУН Государственный научный центр прикладной микробиологии и биотехнологии Роспотребнадзора, Оболенск, Российская Федерация

Миронова Раиса Ивановна / ФБУН Государственный научный центр прикладной микробиологии и биотехнологии Роспотребнадзора, Оболенск, Российская Федерация

Титарева Галина Михайловна / ФБУН Государственный научный центр прикладной микробиологии и биотехнологии Роспотребнадзора, Оболенск, Российская Федерация

Гончарова Юлия Олеговна / ФБУН Государственный научный центр прикладной микробиологии и биотехнологии Роспотребнадзора, Оболенск, Российская Федерация

Маринин Леонид Иванович / ФБУН Государственный научный центр прикладной микробиологии и биотехнологии Роспотребнадзора, Оболенск, Российская Федерация

Мокриевич Александр Николаевич / ФБУН Государственный научный центр прикладной микробиологии и биотехнологии Роспотребнадзора, Оболенск, Российская Федерация
Одним из методов дифференциации B. anthracis от других близкородственных микроорганизмов является его чувствительность к специфическому бактериофагу γ (Гамма). Davison и соавт. установили, что рецептором для фага Гамма является белок BA3367, названный GamR. Целью данного исследования являлась оценка возможности использования гена, кодирующего белок BA3367, в качестве видоспецифического хромосомного маркера для ПЦР-дифференциации B. anthracis от близкородственных бацилл. Применив анализ in silico, мы выявили у B. anthracis трехнуклеотидную
инсерцию 97AAG101, которую использовали для дизайна видоспецифических праймеров и Taq-man зонда. 
Особенностью праймеров было, во-первых, использование инсерции в качестве трех 3'-концевых нуклеотидов прямого праймера и, во-вторых, введение искусственной некомплементарной замены G→С в -4 положении с 3'-конца прямого праймера для повышения специфичности реакции. Сконструированные праймеры и Taq-man зонд показали 100%-ную видоспецифичность в полимеразной цепной реакции (ПЦР) с отсутствием ложных результатов. Мы считаем, что ген, кодирующий белок GamR, является перспективным в качестве видоспецифического хромосомного маркера B. anthracis как при отдельном использовании, так и для применения в мультиплексных ПЦР-тест-системах для идентификации сибиреязвенного микроба и дифференциации его от близкородственных бацилл.

Ключевые слова: B. anthracis, ПЦР-дифференциация, бактериофаг γ.

Для цитирования: Тимофеев В.С., Каптелова В.В., Бахтеева И.В., Миронова Р.И., Титарева Г.М., Гончарова Ю.О., Маринин Л.И., Мокриевич А.Н. Использование гена, кодирующего белок GamR, в качестве видоспецифического хромосомного маркера для дифференциации B. anthracis от близкородственных видов. Бактериология. 2018; 3(3): 22–27.
DOI: 10.20953/2500-1027-2018-3-22-27

Читать статью

Яндекс.Метрика