Протеомный анализ белкового профиля сывороток крови больных аутизмом детей

Автор / Мед учреждения

А.Л.Кайшева / НИИ биомедицинской химии им. В.Н.Ореховича, Москва, Российская Федерация / ООО «ПостгенТех», Москва, Российская Федерация

А.Т.Копылов / НИИ биомедицинской химии им. В.Н.Ореховича, Москва, Российская Федерация

И.Ю.Юров / Научный центр психического здоровья РАМН, Москва, Российская Федерация / Российский национальный исследовательский медицинский университет им. Н.И.Пирогова, Москва, Российская Федерация

С.Г.Ворсанова / Научный центр психического здоровья РАМН, Москва, Российская Федерация

Ю.Б.Юров / Научный центр психического здоровья РАМН, Москва, Российская Федерация / Российский национальный исследовательский медицинский университет им. Н.И.Пирогова, Москва, Российская Федерация / Московский государственный психолого-педагогический университет, Москва, Российская Федерация

Р.А.Галиуллин / НИИ биомедицинской химии им. В.Н.Ореховича, Москва, Российская Федерация

А.С.Анашкина / НИИ биомедицинской химии им. В.Н.Ореховича, Москва, Российская Федерация

А.И.Арчаков / НИИ биомедицинской химии им. В.Н.Ореховича, Москва, Российская Федерация

Ю.Д.Иванов / НИИ биомедицинской химии им. В.Н.Ореховича, Москва, Российская Федерация
Цель. Выявление и аннотация уникального белкового профиля образцов сыворотки крови детей, страдающих аутистическими расстройствами.

Материалы и методы. Для определения белкового профиля образцов сывороток крови трех семей, в которых воспитываются дети с аутистическими расстройствами, использована панорамная масс-спектрометрия высокого разрешения. Анализ результатов измерений осуществлялся с использованием двух наиболее популярных поисковых протеомных машин – Mascot и X!Tandem. Всего исследовали четыре контрольных образца здоровых родителей и пять образцов сывороток крови детей-аутистов. 

Результаты. В результате проведенного панорамного масс-спектрометрического анализа белкового состава девяти обедненных образцов сыворотки крови выяснено, что обедненные образцы различались как по числу идентифицированных белков, так и по белковому составу. Число идентифицированных белков с помощью протеомной поисковой машины Mascot (далее – ППМ Mascot) в образцах обедненных сывороток крови варьировало ±10%, с помощью ППМ X!Tandem – уже ±20%. При сравнении с контрольными образцами в образцах сывороток крови детей-аутистов обнаруживалась немногочисленная группа общих белков, не связанных функционально или структурно. Белки в составе этой группы мы обозначили белковым профилем. Среди этих белков лишь LIM-домен содержащий белок 1 был обнаружен в четырех из пяти образцов, оставшиеся 12 белков этой группы были обнаружены в трех образцах детей, страдающих аутистическими расстройствами.

Заключение. Выявлен уникальный белковый профиль образцов сывороток крови детей-аутистов, в состав которого мы отнесли 13 белков. В дальнейшем будут разработаны количественные масс-спектрометрические мультиплексные методы селективного мониторинга множественных реакций для сверхчувствительной детекции на субфемтомолярном уровне целевых белков профиля в образцах сыворотки крови детей, относящихся к группам риска расстройств аутистического
спектра.

Ключевые слова: аутизм, белковые маркеры, масс-спектрометрия высокого разрешения.

Для цитирования: Кайшева А.Л., Копылов А.Т., Юров И.Ю., Ворсанова С.Г., Юров Ю.Б., Галиуллин Р.А., Анашкина А.С., Арчаков А.И., Иванов Ю.Д. Протеомный анализ белкового профиля сывороток крови больных аутизмом детей. Вопросы практической педиатрии. 2016; 11(5): 12–17. 
DOI: 10.20953/1817-7646-2016-5-12-17

Статья находится в открытом доступе. Читать статью...

Яндекс.Метрика