Клональный состав популяции штаммов Bordetella pertussis, выделенных в России

Автор / Мед учреждения

В.А.Алешкин / Московский НИИ эпидемиологии и микробиологии им. Г.Н.Габричевского, Москва, Российская Федерация

О.Ю.Борисова / Московский НИИ эпидемиологии и микробиологии им. Г.Н.Габричевского, Москва, Российская Федерация

А.В.Алешкин / Московский НИИ эпидемиологии и микробиологии им. Г.Н.Габричевского, Москва, Российская Федерация

Г.А.Ивашинникова / Московский НИИ эпидемиологии и микробиологии им. Г.Н.Габричевского, Москва, Российская Федерация

И.К.Мазурова / Московский НИИ эпидемиологии и микробиологии им. Г.Н.Габричевского, Москва, Российская Федерация

Л.И.Кафарская / Российский национальный исследовательский медицинский университет им. Н.И.Пирогова, Москва, Российская Федерация

Е.Е.Донских / Российский национальный исследовательский медицинский университет им. Н.И.Пирогова, Москва, Российская Федерация

А.С.Пименова / Московский НИИ эпидемиологии и микробиологии им. Г.Н.Габричевского, Москва, Российская Федерация

Цель. Изучение клонального состава популяции штаммов B. pertussis, циркулирующей в России, с помощью мультилокусного секвенирования с применением двух схем – МAST1 и MAST2.

Материалы и методы. В работе изучено 313 штаммов B. pertussis, выделенных от больных коклюшем в России в 1948–2012 гг.; три вакцинных штамма, используемые для производства АКДС-вакцины. Генотипирование штаммов проводили в соответствии с общепринятыми схемами МAST1 и MAST2 для B. pertussis. Филогенетический анализ проводили с построением дендрограмм методом UPGMA и MST.

Результаты. Современная популяция штаммов B. pertussis представлена штаммами 14 различных MAST2-генотипов. Из них большинство (98,6%) принадлежат к новым «невакцинным» генотипам с доминированием (42,5% случаев) штаммов B. pertussis генотипа 322, 24,32% штаммов с генотипом 329 и 12,8% штаммов с генотипом 312. Штаммы B. pertussis «вакцинного» генотипа 111 сохраняются в циркуляции в единичном проценте случаев.

Заключение. В течение 50-летней массовой иммунизации детского населения в популяции штаммов возбудителя коклюша произошли существенные изменения ее клонального состава, проявляющиеся в смене штаммов «вакцинных» генотипов на штаммы новых «невакцинных» генотипов и увеличении гетерогенности популяции с увеличением количества циркулирующих генотипов. Применение схемы генотипирования MAST2 является наиболее оптимальной для проведения мониторинга циркулирующей популяции B. pertussis.

Ключевые слова: Bordetella pertussis, генотип, мультилокусное секвенирование, сиквенс-тип

Стоимость статьи: 100 ք
Получить доступ
Пароль:

Яндекс.Метрика