Дифференциация шести видов листерий с помощью ПЦР-ПДРФ анализа ITS-последовательностей, локализованных между генами 16S и 23S рРНК

Автор / Мед учреждения

Э.А.Светоч / ФБУН Государственный научный центр прикладной микробиологии и биотехнологии Роспотребнадзора, Оболенск, Российская Федерация

Е.И.Асташкин / ФБУН Государственный научный центр прикладной микробиологии и биотехнологии Роспотребнадзора, Оболенск, Российская Федерация

В.Н.Борзенков / ФБУН Государственный научный центр прикладной микробиологии и биотехнологии Роспотребнадзора, Оболенск, Российская Федерация

О.И.Тазина / ФБУН Государственный научный центр прикладной микробиологии и биотехнологии Роспотребнадзора, Оболенск, Российская Федерация

Н.Н.Карцев / ФБУН Государственный научный центр прикладной микробиологии и биотехнологии Роспотребнадзора, Оболенск, Российская Федерация

Н.Р.Ефимочкина / Федеральный исследовательский центр питания, биотехнологии и безопасности пищи, Москва, Российская Федерация

И.П.Мицевич / ФБУН Государственный научный центр прикладной микробиологии и биотехнологии Роспотребнадзора, Оболенск, Российская Федерация

Н.К.Фурсова / ФБУН Государственный научный центр прикладной микробиологии и биотехнологии Роспотребнадзора, Оболенск, Российская Федерация
Предлагаемый метод дифференциации шести видов бактерий рода Listeria основан на анализе полиморфизма длин рестрикционных фрагментов (ПДРФ) внутреннего транскрибируемого спейсера (ITS-локуса), расположенного между генами 16S и 23S рРНК. ITS-локус амплифицировали с помощью специфичных праймеров G1 и L1 и последовательно гидролизовали эндонуклеазами рестрикции BseMII, ScaI и TasI. Длины рестрикционных фрагментов анализировали с помощью электрофореза в агарозном геле. Данная схема позволила на первом этапе дифференцировать листерии патогенного для человека вида Listeria monocytogenes, на втором – листерии вида Listeria innocua, а на третьем – остальные четыре вида листерий – патогенный для животных Listeria ivanovii и непатогенные Listeria seeligeri, Listeria
welshimeri и Listeria grayi.

Ключевые слова: Listeria spp., ПЦР-ПДРФ анализ, ITS-локус, 16S-23S рРНК.

Для цитирования: Светоч Э.А., Асташкин Е.И., Борзенков В.Н., Тазина О.И., Карцев Н.Н., Ефимочкина Н.Р., Мицевич И.П., Фурсова Н.К. Дифференциация шести видов листерий с помощью ПЦР-ПДРФ анализа последовательностей ДНК между генами 16S и 23S рРНК. Бактериология. 2017; 2(1): 46–53.
DOI: 10.20953/2500-1027-2017-1-46-53

Читать статью

Яндекс.Метрика